source: inf'OGN avril 2008

La question du lien entre culture de PGM et maintien de la biodiversité est souvent posée pour la simple raison que les PGM sont des plantes qui s'inscrivent dans un modèle agricole - la monoculture - souvent dénoncé pour ses impacts négatifs sur la biodiversité. Par ailleurs, lorsque l'on parle de biodiversité, on parle de diversité végétale et animale. Or dans les deux cas, les impacts des PGM (dissémination du caractère transgénique aux cultures et plantes sauvages voisines, impacts sur les insectes non cibles...) sur leur environnement alimentent également un possible impact négatif sur la biodiversité.
A titre d'exemple d'impacts sur la biodiversité, en 2005, la Société anglaise Royale des Sciences publié des résultats d'un vaste programme d'évaluation des impacts sur l'environnement de cultures de plantes transgéniques. Ces résultats montraient notamment que les chercheurs avaient constaté que les champs "transgéniques" abritent moins d'abeilles et de papillons, et ils s'inquiètent d'un effet possible sur les oiseaux. En 2007, L'équipe du Pr. Marvier de l'Université de Santa Clara montrait dans un article publié dans la revue Science, que les cultures transgéniques ont des impacts sur les insectes non ciblés par la protéine Bt, phénomène pourtant peu étudié dans le cadre des dossiers de demande d'autorisation.