Dans une étude publiée dans la revue Science Express, des chercheurs de
l'université Wageningen aux Pays-Bas et du Laboratoire national Lawrence
Berkeley aux États-Unis a identifié pour la première fois comment un
réseau de microbes du sol peut collaborer pour combattre des pathogènes
destructeurs.
L'équipe a réalisé cette découverte après avoir examiné le sol d'un
champ de betterave aux Pays-Bas devenu résistant au pathogène tellurique
Rhizoctonia solani, un champignon qui entraîne la pourriture des
racines. Bien que les sols pouvant détruire les agents de maladie ne
sont pas rares, jusqu'à présent seuls quelques microbes impliqués dans
le système immunitaire végétal avaient été identifiés, et des études
antérieures n'ont pu déceler que quelques microbes pouvant combattre des
pathogènes. Dans cette étude, l'équipe a prélevé 17 microbes
telluriques en lutte contre le pathogène destructeur, source de
perturbation pour les betteraves, les plantes et le riz.
Pour identifier ces microbes, l'équipe a utilisé une puce de la
taille d'une carte de crédit capable de détecter la présence de 59 000
espèces de bactéries et d'archées dans des échantillons d'air, d'eau et
de sol, sans culture. La puce a été développée au laboratoire américain
pour identifier non seulement les organismes les plus connus dans un
échantillon environnemental mais également pour découvrir de nouveaux
types, moins communs. Elle compare la séquence d'ADN unique de chaque
espèce de bactérie par rapport à plus d'un million de cibles d'ADN de
référence intégrés dans la puce.
«Des organismes individuels ont déjà été associés à un sol résistant
aux maladies avant, mais nous avons démontré que de nombreux organismes
associés ont un rapport avec ce phénomène», commente Gary Andersen,
l'un des chercheurs du laboratoire.
Source : CORDIS
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