Le débit et la température sont parmi les facteurs les plus structurants pour le milieu aquatique d'eau courante et les plus susceptibles d'être affectés par les évolutions du climat. Ces évolutions ont un impact sur les poissons, compte-tenu de leurs exigences écologiques : besoins en oxygène, tolérance aux variations de température... Les changements climatiques observés pour l'instant semblent encore trop faibles pour conduire à des modifications profondes, comme des invasions ou des extinctions d’espèces. Néanmoins, des chercheurs de l’INRA ont déjà observé des évolutions chez le Saumon atlantique, comme une espérance de vie plus courte, un renouvellement plus rapide des populations ou encore l’augmentation du nombre des mâles précoces conduisant à une stratégie de reproduction excluant la phase marine.